من زوجته الشريفة أمة الملك بنت عبد الله بن محمد بن محمد حميد من آل المؤيد الصغير أهل جراف صنعاء.

  وأما فاطمة بنت الحسن، وكنيتها أم المساكين وكانت بمكانة من الزهد والكمال والعبادة والتقوى، والدتها من آل جزيلان خميس ذو موسى ذو محمد أيضاً، تزوجها السيد حسن بن محسن الكبير الحوثي الحسيني بحوث ولها منه: محسن وعبد الله وعلي، وثلاث بنات، ولكل منهم أولاد بحوث.

[ترجمة الحسين بن الإمام وأولاده]

  أما العلامة الحسين بن الإمام المهدي: فكان من النبلاء الكرام، أهل الأخلاق السامية، والخلال الكريمة، وفاته ¦ سنة (١٣٦٢) هـ بحوث، وقبره بجربة معمر المعروفة، له من الولد: حسن وعبد الله ويحيى، وأمة الرحيم وحورية، أمهم جميعاً الشريفة الفاضلة تقية بنت محسن بن حسن الكبيرالحوثي، إلا يحيى فأمه الشريفة فاطمة بنت زيد بن علي عشيش الحسيني الضرير، وكان من أكابر العلماء بحوث.

  لحسن بن الحسين ابنتان، تزوجتا بحوث، وهما من زوجته الشريفة أمة الرحمن بنت محسن بن أحمد المتوكل الشهاري الحسني، وكانت من أفاضل النساء وأتقاهن، وقد توفيت رحمها الله تعالى.

  وأما عبد الله بن الحسين: فله من الولد: عبد الحميد وعبد الجليل ومحمد وعلي وعصام، من زوجته الشريفة الفاضلة أمة الله بنت أحمد بن يحيى المتوكل